RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 CTSKP43235 329 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 ZP2Q05996 745 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 GSNP06396 782 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 FUT4P22083 530 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 EGR3Q06889 387 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 PPP2R5DQ14738 602 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 SV2CQ496J9 727 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 H0Y8X5 98 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 SYPP08247 313 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 BMP8BP34820 402 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 PLCL1Q15111 1095 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 BVESQ8NE79 360 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 LNPKQ9C0E8 428 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 EPN3Q9H201 632 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 TCFL5Q9UL49 500 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 AKT3Q9Y243 479 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 PDPK1O15530 556 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 VAV1P15498 845 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 TEKQ02763 1124 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 MKL1Q969V6 931 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-215ENST00000498284 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF205O95201 554 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 POU4F1Q01851 419 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 RASGRF1Q13972 1273 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 RASA3Q14644 834 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 LGR4Q9BXB1 951 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 SNTG2Q9NY99 539 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 AGRPO00253 132 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 FKTNO75072 461 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ITGAVP06756 1048 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 GRB10Q13322 594 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 DPH6Q7L8W6 267 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ABI1Q8IZP0 508 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM82A0PJX8 343 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 IGSF3O75054 1194 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 VAMP4O75379 141 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 KCNH1O95259 989 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 CD3EP07766 207 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 AMPD2Q01433 879 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 NFE2L2Q16236 605 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-215ENST00000498284 MTERF2Q49AM1 385 aa6.75□□□□□ -1.33
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