RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511		E9PSI1	815 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	COL6A1	P12109	1028 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CNGA1	P29973	690 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-24	P63145	666 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TFCP2	Q12800	502 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL14	Q16627	93 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	APBA2	Q99767	749 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRF	P10586	1907 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF11	O95390	407 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	BAG3	O95817	575 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	GUCD1	Q96NT3	240 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	FEZ1	Q99689	392 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PORCN	Q9H237	461 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	AXIN1	O15169	862 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ADH1C	P00326	375 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNA1	P78396	465 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE2B	O14633	110 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	MSC	O60682	206 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	NR5A1	Q13285	461 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	HPS1	Q92902	700 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP6NL	Q92738	828 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	MEIS3	Q99687	375 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	RTP1	P59025	263 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.25	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	FLT1	P17948	1338 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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