RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489077.1

AC004889.1-208, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC004889.1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004889.1-208ENST00000489077 GPATCH3Q96I76 525 aa6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 SPC25Q9HBM1 224 aa6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.48□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 APPP05067 770 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 PGK2P07205 417 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 CLTBP09497 229 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 AKR1A1P14550 325 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 AKR1B1P15121 316 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 PDE4AP27815 886 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 TDO2P48775 406 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 LRRC41Q15345 812 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 PANK1Q8TE04 598 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 MAML3Q96JK9 1138 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 CCDC17Q96LX7 622 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 VCPKMTQ9H867 229 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.47□□□□□ -1.37
AC004889.1-208ENST00000489077 A0A1W2PRG0 241 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 USP17L12C9JPN9 530 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 USP17L21D6R901 530 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 HRO43593 1189 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 COBLO75128 1261 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 ZBED4O75132 1171 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 RAB11FIP3O75154 756 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 PGK1P00558 417 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 RLBP1P12271 317 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 EEF2P13639 858 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 STAT3P40763 770 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 CDK8P49336 464 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 FPGSQ05932 587 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 SHHQ15465 462 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 CPXCR1Q8N123 301 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 TRPV1Q8NER1 839 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 TMX2Q9Y320 296 aa6.46□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 A0A1W2PQY0 241 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 PRKAB2O43741 272 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 GUCY1A2P33402 732 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 ADD2P35612 726 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 TLE2Q04725 743 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 GABPAQ06546 454 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 PPM1EQ8WY54 764 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 MYLIPQ8WY64 445 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 KIFC2Q96AC6 838 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 GUCD1Q96NT3 240 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 TINF2Q9BSI4 451 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.45□□□□□ -1.38
AC004889.1-208ENST00000489077 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms