RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476860.1

MFSD1-211, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-211ENST00000476860 C9IYK1 514 aa6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 BBS9Q3SYG4 887 aa6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 CDKAL1Q5VV42 579 aa6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 ANKS3Q6ZW76 656 aa6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 ARMC5Q96C12 935 aa6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 CADPSQ9ULU8 1353 aa6□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 H3BS24 57 aa5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 CKAP2LQ8IYA6 745 aa5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 GDNFP39905 211 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 SLC7A5Q01650 507 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 GNPTABQ3T906 1256 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 VHLLQ6RSH7 139 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 KIRREL1Q96J84 757 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 NCANO14594 1321 aa5.98□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 CUX2O14529 1486 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 SHISA3A0PJX4 238 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 KLF4O43474 513 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 SRFP11831 508 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 DCAF15Q66K64 600 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 LILRA6Q6PI73 481 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.97□□□□□ -1.45
MFSD1-211ENST00000476860 WIZO95785 1651 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 B2RBV5 119 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 SHOXO15266 292 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 C1QTNF9P0C862 333 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 NCAPHQ15003 741 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 FXNQ16595 210 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 DRC1Q96MC2 740 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 HAUS7Q99871 368 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 CD320Q9NPF0 282 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.96□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 CBFA2T2O43439 604 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 MED14OSP0DP75 135 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 RAB33AQ14088 237 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 DDR2Q16832 855 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 UBXN4Q92575 508 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 UBE2FQ969M7 185 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 NBPF4Q96M43 638 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.95□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 SIGLEC6O43699 453 aa5.94□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 DDAH1O94760 285 aa5.94□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 PRAMEF1O95521 474 aa5.94□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 EPHX1P07099 455 aa5.94□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 GAB4Q2WGN9 574 aa5.94□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.94□□□□□ -1.46
MFSD1-211ENST00000476860 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms