RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 AP3B2Q13367 1082 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 PICALMQ13492 652 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 MICALL2Q8IY33 904 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 JMYQ8N9B5 988 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 RPTORQ8N122 1335 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 ARID2Q68CP9 1835 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 F8W031 263 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 SPTLC2O15270 562 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 ASNSP08243 561 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 OAZ1P54368 228 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 VCPKMTQ9H867 229 aa7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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PRKCI-202ENST00000476635 GNA11P29992 359 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 CIITAP33076 1130 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 ICA1Q05084 483 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 GOPCQ9HD26 462 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 FEM1BQ9UK73 627 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 BCS1LQ9Y276 419 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 A0A1W2PRG0 241 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 HYIQ5T013 277 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 DCAF15Q66K64 600 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 HACL1Q9UJ83 578 aa7.4□□□□□ -1.22
PRKCI-202ENST00000476635 BTBD18B2RXH4 712 aa7.4□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 IRF6O14896 467 aa7.4□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 MRE11P49959 708 aa7.4□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.4□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 OXER1Q8TDS5 423 aa7.4□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 MTMR9Q96QG7 549 aa7.4□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 NDUFB10O96000 172 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 SHC4Q6S5L8 630 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 REPS2Q8NFH8 660 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 AK8Q96MA6 479 aa7.39□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 TBX3O15119 743 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 MYL1P05976 194 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 SEPT2Q15019 361 aa7.39□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 Q4G0T1 1027 aa7.39□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 C6orf50Q9HD87 102 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CABP5Q9NP86 173 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 TOMM22Q9NS69 142 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.39□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.39□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 KLRG1Q96E93 195 aa7.39□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 ABCB11O95342 1321 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 SHTN1A0MZ66 631 aa7.38□□□□□ -1.23
PRKCI-202ENST00000476635 C19orf81C9J6K1 198 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 EGFRP00533 1210 aa7.38□□□□□ -1.23
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PRKCI-202ENST00000476635 LIG1P18858 919 aa7.38□□□□□ -1.23
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