RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471438.2

CSMD2-208, Transcript of CUB and Sushi multiple domains 2, human

TSL 5

Gene CSMD2, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSMD2-208	ENST00000471438	LEFTY1	O75610	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	NFKB2	Q00653	900 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PDE4C	Q08493	712 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438		A0A1W2PP55	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438		H3BRB1	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	NSD2	O96028	1365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	IGHD	P01880	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ADRB1	P08588	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSMD2-208	ENST00000471438	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	ZFYVE9	O95405	1425 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	METTL12	A8MUP2	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	ECEL1	O95672	775 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	RGS19	P49795	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	EHD4	Q9H223	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	PCNT	O95613	3336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	APAF1	O14727	1248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	BCAR3	O75815	825 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	GDNF	P39905	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	BECN1	Q14457	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	TCF12	Q99081	682 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	IL16	Q14005	1332 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CELA3B	P08861	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	KCNA6	P17658	529 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	GRIA4	P48058	902 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	GPR182	O15218	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	SUV39H1	O43463	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	DDIT3	P35638	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	GGT6	Q6P531	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSMD2-208	ENST00000471438	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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