RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNQ2O43526 872 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNH1O95259 989 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 EOMESO95936 686 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 BMP3P12645 472 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP4K2Q12851 820 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CDK5R2Q13319 367 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 MBTPS1Q14703 1052 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 FIBCD1Q8N539 461 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 DLX3O60479 287 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 PROCP04070 461 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 COL8A1P27658 744 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 KIR3DL1P43629 444 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 GFRA1P56159 465 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 GABREP78334 506 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 PAOXQ6QHF9 649 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF180Q86T96 592 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 BRF1Q92994 677 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC140Q96MF4 163 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-207ENST00000470201 SIGLEC6O43699 453 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 EFCAB14O75071 495 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 SCG5P05408 212 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXC12P31275 282 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP2R5DQ14738 602 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 NFKBIBQ15653 356 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 MARCH6O60337 910 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRN2O75325 713 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 CPP00450 1065 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 SDSP20132 328 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 AMPD2Q01433 879 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 BRAPQ7Z569 592 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 CHST7Q9NS84 486 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 MCM8Q9UJA3 840 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 H0Y8X5 98 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 LEFTY1O75610 366 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAMEF1O95521 474 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 PDGFRBP09619 1106 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM87AP0C7U9 286 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 ITIH2P19823 946 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 BEND4Q6ZU67 534 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 JAMLQ86YT9 394 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPRN2Q92932 1015 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 C1orf159Q96HA4 380 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 Q96M66 194 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RABGGTB-207ENST00000470201 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms