RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, human

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGIP1-208	ENST00000468570	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	MPO	P05164	745 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	TGM1	P22735	817 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	FBLN1	P23142	703 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CPZ	Q66K79	652 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	C6	P13671	934 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ATF2	P15336	505 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF20	P17024	532 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CYP4F8	P98187	520 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ABLIM1	O14639	778 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	NOBOX	O60393	691 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CYR61	O00622	381 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	UBOX5	O94941	541 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	TACR2	P21452	398 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	TACR1	P25103	407 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	GBP1	P32455	592 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ARL4A	P40617	200 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	FOXO4	P98177	505 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	F13A1	P00488	732 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	GDF5	P43026	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SGIP1-208	ENST00000468570	HTR3B	O95264	441 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	PFKL	P17858	780 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	CTSK	P43235	329 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	MVK	Q03426	396 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SGIP1-208	ENST00000468570	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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