RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 RESTQ13127 1097 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 HOOK2Q96ED9 719 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 PIGSQ96S52 555 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 ELP1O95163 1332 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 FIBPO43427 364 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 PTPRAP18433 802 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 ADAMTS3O15072 1205 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 SNAP25P60880 206 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 USP17L10C9JJH3 530 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 SCG2P13521 617 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 KRT85P78386 507 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 SPP2Q13103 211 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 VGLL4Q14135 290 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 DCAF4Q8WV16 495 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 WASF1Q92558 559 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 GMCL1Q96IK5 515 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 FEZ1Q99689 392 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM232C9JQI7 657 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 OXER1Q8TDS5 423 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 VCPKMTQ9H867 229 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 PICK1Q9NRD5 415 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM75PA6NK02 468 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 BMP3P12645 472 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 MTMR2Q13614 643 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 BTBD18B2RXH4 712 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM29Q14134 588 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 GOPCQ9HD26 462 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 MMP1P03956 469 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 MAP3K9P80192 1104 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 NR5A1Q13285 461 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 WDR90Q96KV7 1748 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 NPY5RQ15761 445 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 SMARCA1P28370 1054 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 COA7Q96BR5 231 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 STXBP3O00186 592 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 SH2D4AQ9H788 454 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 ELP3Q9H9T3 547 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 NF2P35240 595 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 WDR18Q9BV38 432 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 GINM1Q9NU53 330 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 BARHL2Q9NY43 387 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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CAPN3-209ENST00000466222 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 HMGCS2P54868 508 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 BACE1P56817 501 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 NLRP5P59047 1200 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPN3-209ENST00000466222 FAM205CA6NFA0 338 aa21.33■■□□□ 1
CAPN3-209ENST00000466222 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.33■■□□□ 1
CAPN3-209ENST00000466222 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.33■■□□□ 1
CAPN3-209ENST00000466222 LDHDQ86WU2 507 aa21.33■■□□□ 1
CAPN3-209ENST00000466222 KIFC2Q96AC6 838 aa21.33■■□□□ 1
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