RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.13■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.13■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.12■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.12■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 PTPREP23469 700 aa25.12■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 COPB2P35606 906 aa25.12■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 RGS2P41220 211 aa25.12■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.12■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 CPXCR1Q8N123 301 aa25.12■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 PNMA1Q8ND90 353 aa25.12■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 REPS2Q8NFH8 660 aa25.12■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.12■■□□□ 1.61
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ABCD4-202ENST00000460308 STRNO43815 780 aa25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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ABCD4-202ENST00000460308 ELNP15502 786 aa25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 SLC4A3P48751 1232 aa25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 UBXN2AP68543 259 aa25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 MORN1Q5T089 497 aa25.11■■□□□ 1.61
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ABCD4-202ENST00000460308 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF333Q96JL9 665 aa25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 REC8O95072 547 aa25.1■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 MAP2K5Q13163 448 aa25.1■■□□□ 1.61
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ABCD4-202ENST00000460308 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.1■■□□□ 1.61
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ABCD4-202ENST00000460308 CHST3Q7LGC8 479 aa25.09■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.09■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 ATP2A1O14983 1001 aa25.08■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 FCER1AP12319 257 aa25.08■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 SLC16A2P36021 539 aa25.08■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 OAZ1P54368 228 aa25.08■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 SOX10P56693 466 aa25.08■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 GRB14Q14449 540 aa25.08■■□□□ 1.61
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ABCD4-202ENST00000460308 SEC23AQ15436 765 aa25.08■■□□□ 1.61
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ABCD4-202ENST00000460308 TTBK2Q6IQ55 1244 aa25.08■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 DPP9Q86TI2 863 aa25.08■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ABCD4-202ENST00000460308 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
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ABCD4-202ENST00000460308 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.07■■□□□ 1.6
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ABCD4-202ENST00000460308 PRC1O43663 620 aa25.05■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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ABCD4-202ENST00000460308 KCTD2Q14681 263 aa25.05■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC174Q6PII3 467 aa25.05■■□□□ 1.6
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ABCD4-202ENST00000460308 SNAP25P60880 206 aa25.04■■□□□ 1.6
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ABCD4-202ENST00000460308 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.04■■□□□ 1.6
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ABCD4-202ENST00000460308 MTA3Q9BTC8 594 aa25.04■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 FBXO40Q9UH90 709 aa25.04■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 RIPK3Q9Y572 518 aa25.04■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 HOXC6P09630 235 aa25.03■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 CHST13Q8NET6 341 aa25.03■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.03■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 TRIB2Q92519 343 aa25.03■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM87BQ96K49 555 aa25.03■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.03■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 RNF208Q9H0X6 261 aa25.03■■□□□ 1.6
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ABCD4-202ENST00000460308 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 CCL5P13501 91 aa25.02■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 TKFCQ3LXA3 575 aa25.02■■□□□ 1.6
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ABCD4-202ENST00000460308 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.02■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 TMTC2Q8N394 836 aa25.02■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 DDX11Q96FC9 970 aa25.02■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.02■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.02■■□□□ 1.6
ABCD4-202ENST00000460308 ALAS1P13196 640 aa25.01■■□□□ 1.59
ABCD4-202ENST00000460308 CCL14Q16627 93 aa25.01■■□□□ 1.59
ABCD4-202ENST00000460308 MFSD14CQ5VZR4 134 aa25.01■■□□□ 1.59
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