RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 DGKHQ86XP1 1220 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 TEX11Q8IYF3 940 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 KLRF2D3W0D1 207 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 PRCPP42785 496 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 PAK1Q13153 545 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 PICALMQ13492 652 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 GRM4Q14833 912 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 LETM2Q2VYF4 491 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 TEX35Q5T0J7 233 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 RASA1P20936 1047 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 NAPAP54920 295 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 GYPCP04921 128 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 CLCN6P51797 869 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 EYA3Q99504 573 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 TOM1O60784 492 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 ABL1P00519 1130 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 UBA7P41226 1012 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 KCNJ18B7U540 433 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 CCDC175P0C221 793 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 TRAPPC10P48553 1259 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 KCNJ12Q14500 433 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 STXBP3O00186 592 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 RIMBP2O15034 1052 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 MFAP3LO75121 409 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 CDK8P49336 464 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 DISC1Q9NRI5 854 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 C6orf229H3BNL8 230 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 GSTO1P78417 241 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 CD209Q9NNX6 404 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 LRRC15Q8TF66 581 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 UIMC1Q96RL1 719 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 UBXN1Q04323 297 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 PDE4CQ08493 712 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 TMEM260Q9NX78 707 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 BARHL2Q9NY43 387 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS3-202ENST00000460120 TADA3O75528 432 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 DMTNQ08495 405 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 HPS3Q969F9 1004 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 CEP95Q96GE4 821 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 SMCO2A6NFE2 343 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 PBX1P40424 430 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 KIFC2Q96AC6 838 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 PANX2Q96RD6 677 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 PIGSQ96S52 555 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 TPM1P09493 284 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 SLURP2P0DP57 97 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 TECP42680 631 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 GGA1Q9UJY5 639 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 USP17L5A8MUK1 530 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 LDHCP07864 332 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 GNAQP50148 359 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 KRT222Q8N1A0 295 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 FLT1P17948 1338 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS3-202ENST00000460120 RAD21O60216 631 aa20.43■□□□□ 0.86
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