RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC25A27O95847 323 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTPREP23469 700 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MCCP23508 829 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GRB14Q14449 540 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NBPF11Q86T75 865 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM160B2Q86V87 743 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SOCS4Q8WXH5 440 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TOMM22Q9NS69 142 aa13.21□□□□□ -0.29
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC27A2O14975 620 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDHBP11177 359 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GRK4P32298 578 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COPB2P35606 906 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STAT3P40763 770 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC1A4P43007 532 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CASC1Q6TDU7 716 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYB5R4Q7L1T6 521 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAET1EQ8TD07 263 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUDT12Q9BQG2 462 aa13.2□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF536O15090 1300 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM232C9JQI7 657 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADCY3O60266 1144 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CAPN2P17655 700 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERCC3P19447 782 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STAT2P52630 851 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF543Q08ER8 600 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRDNQ13061 729 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CREB3L3Q68CJ9 461 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NCOA7Q8NI08 942 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TEX13BQ9BXU2 312 aa13.19□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNKSO95271 1327 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANTXR2P58335 489 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAP2K5Q13163 448 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PNMA1Q8ND90 353 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRR12Q9ULL5 1215 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF236Q9UL36 1845 aa13.18□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBED4O75132 1171 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGS2P41220 211 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCTD1Q719H9 257 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIPK3Q9Y572 518 aa13.17□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDR19Q8NEZ3 1342 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAD21O60216 631 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COBLO75128 1261 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMGCRP04035 888 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSPA4P34932 840 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TROAPQ12815 778 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TKFCQ3LXA3 575 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF20Q5VTR2 975 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OLFML2BQ68BL8 750 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TTBK2Q6IQ55 1244 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RASGRP2Q7LDG7 609 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RASEFQ8IZ41 740 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHST13Q8NET6 341 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SH3TC2Q8TF17 1288 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIFC2Q96AC6 838 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAP3K14Q99558 947 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APBA2Q99767 749 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBAC1Q9BSL1 405 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAF1Q9H063 256 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PNMA2Q9UL42 364 aa13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GJB1P08034 283 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FCER1AP12319 257 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELNP15502 786 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LIFRP42702 1097 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBXN2AP68543 259 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMTC2Q8N394 836 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXL16Q8N461 479 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIB2Q92519 343 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM87BQ96K49 555 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KAT14Q9H8E8 782 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXO40Q9UH90 709 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms