RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PRAME-209ENST00000439106 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-209ENST00000439106 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-209ENST00000439106 OGDHLQ9ULD0 1010 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-209ENST00000439106 RIPK3Q9Y572 518 aa16.4■□□□□ 0.22
PRAME-209ENST00000439106 STRNO43815 780 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 ORC4O43929 436 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A27O95847 323 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 FCER1AP12319 257 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 BMP3P12645 472 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 MCCP23508 829 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 LHX8Q68G74 356 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 ZMYM6O95789 1325 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 NEDD4P46934 1319 aa16.39■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 TMEM232C9JQI7 657 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 IGHA2P01877 340 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 CYBAP13498 195 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 TTC22Q5TAA0 569 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 ANO1Q5XXA6 986 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 KCTD1Q719H9 257 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 PFASO15067 1338 aa16.38■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 FGRP09769 529 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 SLC1A4P43007 532 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 SNAP25P60880 206 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 KCTD2Q14681 263 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 MAML3Q96JK9 1138 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 TEX13BQ9BXU2 312 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 FEM1BQ9UK73 627 aa16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 EVI5O60447 810 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 ZBED4O75132 1171 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 TICAM2Q86XR7 235 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 HOMER2Q9NSB8 354 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 STAT2P52630 851 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 CCDC96Q2M329 555 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 GMCL1Q96IK5 515 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 DNAH12Q6ZR08 3092 aa16.35■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 CCDC174Q6PII3 467 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 SKAP1Q86WV1 359 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 AGBL1Q96MI9 1066 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 SLC5A4Q9NY91 659 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 ZNF536O15090 1300 aa16.34■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PRAME-209ENST00000439106 HIP1O00291 1037 aa16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 ZNF213O14771 459 aa16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 ATP2A1O14983 1001 aa16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 COL6A1P12109 1028 aa16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 COPB2P35606 906 aa16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 SLC16A2P36021 539 aa16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 NOVP48745 357 aa16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 CAPN2P17655 700 aa16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 FAM160B2Q86V87 743 aa16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 DDX11Q96FC9 970 aa16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 TINF2Q9BSI4 451 aa16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.32■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 LTBP2Q14767 1821 aa16.31■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 B4E1Z4 1266 aa16.31■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 SEPT4O43236 478 aa16.31■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 KDM4AO75164 1064 aa16.31■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 SLC34A2O95436 690 aa16.31■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 SYN1P17600 705 aa16.31■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 LRRC26Q2I0M4 334 aa16.31■□□□□ 0.2
PRAME-209ENST00000439106 DCAF4Q8WV16 495 aa16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms