RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 TCTN2Q96GX1 697 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 APBA2Q99767 749 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 DUSP13Q9UII6 198 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PDPK1O15530 556 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PRNPP04156 253 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 LTKP29376 864 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 IKZF1Q13422 519 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 GAB4Q2WGN9 574 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CREG2Q8IUH2 290 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 FIBCD1Q8N539 461 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 FLCNQ8NFG4 579 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 LGR4Q9BXB1 951 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PRR13Q9NZ81 148 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 H0Y8X5 98 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ADAMTS4O75173 837 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ESR1P03372 595 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 NAT2P11245 290 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CTSKP43235 329 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 RASA3Q14644 834 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SNTG2Q9NY99 539 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 A0A087WZG4 1122 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 WNT11O96014 354 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 EGR3Q06889 387 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 AKT3Q9Y243 479 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 VAMP4O75379 141 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 SYPP08247 313 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 ZP2Q05996 745 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 RASGRF1Q13972 1273 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 NFE2L2Q16236 605 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 MTERF2Q49AM1 385 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 SPATC1Q76KD6 591 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 BVESQ8NE79 360 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 MKL1Q969V6 931 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 PIF1Q9H611 641 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 TCFL5Q9UL49 500 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 AGRPO00253 132 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 FKTNO75072 461 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 KCNH1O95259 989 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 GSNP06396 782 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 ITGAVP06756 1048 aa6.45□□□□□ -1.38
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RBM39-211ENST00000426951 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 EPN3Q9H201 632 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 TBX1O43435 398 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 CD3EP07766 207 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 BMP8BP34820 402 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 DNAJC7Q99615 494 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.44□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 VAV1P15498 845 aa6.43□□□□□ -1.38
RBM39-211ENST00000426951 FUT4P22083 530 aa6.43□□□□□ -1.38
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