RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418576.3

SEMA3B-202, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SEMA3B, Length 1,765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-202ENST00000418576 LBX2Q6XYB7 198 aa21.55■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 KLRF2D3W0D1 207 aa21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 TBC1D8O95759 1140 aa21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 RXRAP19793 462 aa21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 GNAQP50148 359 aa21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 PPP2R5BQ15173 497 aa21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 MB21D1Q8N884 522 aa21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 FDX1P10109 184 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 SLC16A2P36021 539 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 ATG4CQ96DT6 458 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.53■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 VWA5AO00534 786 aa21.52■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 ZBED4O75132 1171 aa21.52■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 RTN1Q16799 776 aa21.52■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.52■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 CPA4Q9UI42 421 aa21.52■■□□□ 1.04
SEMA3B-202ENST00000418576 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 C17orf99Q6UX52 265 aa21.51■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.51■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.51■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.51■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.51■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.51■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.5■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 SMARCA1P28370 1054 aa21.5■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.5■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.5■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.49■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CPVLQ9H3G5 476 aa21.49■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.49■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.49■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.49■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.49■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 BCRP11274 1271 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 ERVK-9P63128 1117 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 ERVK-24P63145 666 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CCNA1P78396 465 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 PLS1Q14651 629 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 NID2Q14112 1375 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 GPR25O00155 361 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 MCM2P49736 904 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 OAZ1P54368 228 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 STK3Q13188 491 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 BTBD7Q9P203 1132 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 PNMA2Q9UL42 364 aa21.48■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 SP3Q02447 781 aa21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CPXCR1Q8N123 301 aa21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 TSKSQ9UJT2 592 aa21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 RLFQ13129 1914 aa21.47■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CPLX1O14810 134 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 ATP2A1O14983 1001 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CNMDO75829 334 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CDC27P30260 824 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 STAT3P40763 770 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 NBPF11Q86T75 865 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 REPS2Q8NFH8 660 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SEMA3B-202ENST00000418576 PFKFB2O60825 505 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms