RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 DGKZQ13574 1117 aa16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 MOGSQ13724 837 aa16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 FAM160B2Q86V87 743 aa16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC82Q8N4S0 544 aa16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 SLC26A6Q9BXS9 759 aa16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 CPVLQ9H3G5 476 aa16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 V9GY48 417 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 DTNBO60941 627 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 DEXIO95424 95 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 DDIT3P35638 169 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 SLC16A2P36021 539 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 STAT2P52630 851 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 PKN1Q16512 942 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 RGMBQ6NW40 437 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 DDX11Q96FC9 970 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.65■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 RLFQ13129 1914 aa16.64■□□□□ 0.26
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L15C9J2P7 530 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L11C9JVI0 530 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L18D6R9N7 530 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L22D6RA61 530 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L19D6RCP7 530 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L20D6RJB6 530 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 GTF2A2P52657 109 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 USP17L24Q0WX57 530 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 RGS22Q8NE09 1264 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 KIF3AQ9Y496 699 aa16.64■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PARP14Q460N5 1801 aa16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PPFIA3O75145 1194 aa16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 CETPP11597 493 aa16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 APLP1P51693 650 aa16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 WASF1Q92558 559 aa16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC102AQ96A19 550 aa16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SLF1Q9BQI6 1058 aa16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.63■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SLC10A3P09131 477 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 FDX1P10109 184 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PDCP20941 246 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 COG2Q14746 738 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 TREML2Q5T2D2 321 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 GPAT2Q6NUI2 795 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 FAM184AQ8NB25 1140 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PIGSQ96S52 555 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 CREBZFQ9NS37 354 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 MYPNQ86TC9 1320 aa16.62■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 ZBTB5O15062 677 aa16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 FLOT1O75955 427 aa16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SCG2P13521 617 aa16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 ALG1Q9BT22 464 aa16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 HOXC10Q9NYD6 342 aa16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.61■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SYT1P21579 422 aa16.6■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.6■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 KIFC2Q96AC6 838 aa16.6■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 AIFM3Q96NN9 605 aa16.6■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.6■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms