RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403807.3

VPREB1-202, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB1, Length 755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-202ENST00000403807 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.01■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.01■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 ABHD8Q96I13 439 aa16.01■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 TM6SF1Q9BZW5 370 aa16.01■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.01■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SPATC1LQ9H0A9 340 aa16.01■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SENP2Q9HC62 589 aa16.01■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CASTP20810 708 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 MAPK4P31152 587 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 STAT3P40763 770 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 OTOP1Q7RTM1 612 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 COA7Q96BR5 231 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 PRR12Q9ULL5 1215 aa16■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SLC25A27O95847 323 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CALM1P0DP23 149 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CALM2P0DP24 149 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CALM3P0DP25 149 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CPA1P15085 419 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 RPS6KB1P23443 525 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SLC16A2P36021 539 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 PRMT2P55345 433 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 TROAPQ12815 778 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 RUFY3Q7L099 469 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF654Q8IZM8 581 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 REPS2Q8NFH8 660 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 TRIM47Q96LD4 638 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 TCEANC2Q96MN5 208 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 MAP3K14Q99558 947 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.99■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 ATP2A1O14983 1001 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 DDAH1O94760 285 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CTGFP29279 349 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 COPB2P35606 906 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 OAZ1P54368 228 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 GRM4Q14833 912 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 WDR78Q5VTH9 848 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 Q6ZUG5 572 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CPXCR1Q8N123 301 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 UBA5Q9GZZ9 404 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 PORCNQ9H237 461 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 MROH8Q9H579 483 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.98■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 KLRF2D3W0D1 207 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 ERCC3P19447 782 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 KIF5BP33176 963 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CAP1Q01518 475 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 GPR142Q7Z601 462 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 FBXL16Q8N461 479 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 TEX13BQ9BXU2 312 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SRRDQ9UH36 339 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.97■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 STRNO43815 780 aa15.96■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SLC4A3P48751 1232 aa15.96■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 GNAQP50148 359 aa15.96■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.96■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.96■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 PNMA2Q9UL42 364 aa15.96■□□□□ 0.15
VPREB1-202ENST00000403807 CCDC85CA6NKD9 419 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 SNAP25P60880 206 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 CCDC174Q6PII3 467 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 ADGRF4Q8IZF3 695 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 FANCBQ8NB91 859 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 RAET1EQ8TD07 263 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 BRF1Q92994 677 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 IL17RAQ96F46 866 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 MYL10Q9BUA6 226 aa15.95■□□□□ 0.14
VPREB1-202ENST00000403807 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms