RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 DNM3Q9UQ16 869 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 KIAA0232Q92628 1395 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP2AO43633 222 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 MAP4K1Q92918 833 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM170AA1A519 330 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 VSTM4Q8IW00 320 aa20.44■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 EVI5O60447 810 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 RASSF7Q02833 373 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 GCKRQ14397 625 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 CCT6BQ92526 530 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ITGA6P23229 1130 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ARID5BQ14865 1188 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 TAF11Q15544 211 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 KSR1Q8IVT5 923 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 DCAF5Q96JK2 942 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 GCNT3O95395 438 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 IFNB1P01574 187 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 SMTNP53814 917 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 JAG2Q9Y219 1238 aa20.43■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 CHUKO15111 745 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 NAA35Q5VZE5 725 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC89Q8N998 374 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 GSDMAQ96QA5 445 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ZMYM6O95789 1325 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 CRCPO75575 148 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 NR1D1P20393 614 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 C2orf54Q08AI8 447 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ALS2CLQ60I27 953 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 TRPM2O94759 1503 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 PALM2Q8IXS6 379 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP2A3Q93084 1043 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 SETDB2Q96T68 719 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCC2Q92887 1545 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 POLE2P56282 527 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 MYCT1Q8N699 235 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 LGR6Q9HBX8 967 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 SAMD9Q5K651 1589 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ADCY7P51828 1080 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 NGLY1Q96IV0 654 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 IL9RQ01113 521 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.41■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ADCY9O60503 1353 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 TEX11Q8IYF3 940 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP6R2O75170 966 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 SCOCQ9UIL1 159 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 PHBP35232 272 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF790Q6PG37 636 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 CASC4Q6P4E1 433 aa20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.39■□□□□ 0.86
AMIGO1-202ENST00000369864 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms