RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 MCM3APO60318 1980 aa9.08□□□□□ -0.96
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A27O95847 323 aa9.07□□□□□ -0.96
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SGMS1-201ENST00000361543 PDE4AP27815 886 aa9.07□□□□□ -0.96
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SGMS1-201ENST00000361543 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.04□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 MTMR7Q9Y216 660 aa9.04□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.04□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 RAD50Q92878 1312 aa9.04□□□□□ -0.96
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF213O14771 459 aa9.03□□□□□ -0.96
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