RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 LONRF3Q496Y0 759 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP2C19P33261 490 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6V1E1P36543 226 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 NAPAP54920 295 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MYH6P13533 1939 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 LZICQ8WZA0 190 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCC2Q92887 1545 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT8P05787 483 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 RANBP1P43487 201 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D8O95759 1140 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 DNM2P50570 870 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS6KA2Q15349 733 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TM6SF1Q9BZW5 370 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL7Q8IXQ5 586 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ESRRBO95718 433 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 OCA2Q04671 838 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CHST3Q7LGC8 479 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SEPT8Q92599 483 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX12Q9BXU0 123 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SNRKQ9NRH2 765 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 STOML1Q9UBI4 398 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 GRAMD4Q6IC98 578 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX11Q8IYF3 940 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINB2P05120 415 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD35Q8N283 1001 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 LAD1O00515 517 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TNFAIP3P21580 790 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ADALQ6DHV7 355 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC43Q8N309 656 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 APOEP02649 317 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PCP11498 1178 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT4P19013 534 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PLIN2Q99541 437 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINI2O75830 405 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 BAG2O95816 211 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PYGLP06737 847 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC138Q96M89 665 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MTRQ99707 1265 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 C4BPBP20851 252 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TERB1Q8NA31 727 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 STX8Q9UNK0 236 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 EFCAB14O75071 495 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 RAP1GDS1P52306 607 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PAG1Q9NWQ8 432 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINB6P35237 376 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC25Q96NG3 672 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC27A2O14975 620 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXB7P09629 217 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CPA1P15085 419 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PLCB4Q15147 1175 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD7Q92527 254 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC78A2IDD5 438 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CHMP2AO43633 222 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PDZD8Q8NEN9 1154 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 NR1D1P20393 614 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 CAV1Q03135 178 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ADCY2Q08462 1091 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 IGBP1P78318 339 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 RASA3Q14644 834 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-201ENST00000356331 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms