RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 FNBP1Q96RU3 617 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 KRT9P35527 623 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 MAGEA1P43355 309 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 BPIFB4P59827 614 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 CDR2Q01850 454 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 STAT1P42224 750 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 ATP10DQ9P241 1426 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 CCDC159P0C7I6 412 aa6.02□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 POLE2P56282 527 aa6.02□□□□□ -1.44
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PTPRB-202ENST00000334414 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.02□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.02□□□□□ -1.44
PTPRB-202ENST00000334414 KIAA0232Q92628 1395 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRB-202ENST00000334414 PODXLO00592 558 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRB-202ENST00000334414 ARHGDIAP52565 204 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRB-202ENST00000334414 NEK9Q8TD19 979 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRB-202ENST00000334414 PANX2Q96RD6 677 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRB-202ENST00000334414 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.02□□□□□ -1.45
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