RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 RAD21O60216 631 aa22.24■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 NDUFB10O96000 172 aa22.24■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 PGK1P00558 417 aa22.24■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.24■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.24■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.23■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 KIAA0355O15063 1070 aa22.23■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 ADAMTS4O75173 837 aa22.23■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.23■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 DDX11Q96FC9 970 aa22.23■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.23■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 A0A1W2PQY0 241 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 ZBED4O75132 1171 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 CLTBP09497 229 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 TOX2Q96NM4 488 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 RIPK3Q9Y572 518 aa22.22■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 GPAA1O43292 621 aa22.21■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.21■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.21■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.21■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.21■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.21■■□□□ 1.15
PUS1-201ENST00000322060 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 ITGB8P26012 769 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 OAZ1P54368 228 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 FBXO40Q9UH90 709 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 FEM1BQ9UK73 627 aa22.2■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 FDX1P10109 184 aa22.19■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 TDO2P48775 406 aa22.19■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 ACLYP53396 1101 aa22.19■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 CHST13Q8NET6 341 aa22.19■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 CEP95Q96GE4 821 aa22.19■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 FAM161BQ96MY7 647 aa22.19■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 TTLL1O95922 423 aa22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 RAG1P15918 1043 aa22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 CPXCR1Q8N123 301 aa22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 APPP05067 770 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 FAAP100Q0VG06 881 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 ACVR2BQ13705 512 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 KIFC2Q96AC6 838 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.17■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.16■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 ELP1O95163 1332 aa22.16■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.16■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 M0R2C6 588 aa22.16■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 KCNA10Q16322 511 aa22.16■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 PRDM1O75626 825 aa22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 EPHB4P54760 987 aa22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 PDE4BQ07343 736 aa22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 FGD4Q96M96 766 aa22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.14■■□□□ 1.14
PUS1-201ENST00000322060 ERC2O15083 957 aa22.14■■□□□ 1.13
PUS1-201ENST00000322060 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PUS1-201ENST00000322060 BMP3P12645 472 aa22.14■■□□□ 1.13
PUS1-201ENST00000322060 CDK7P50613 346 aa22.14■■□□□ 1.13
PUS1-201ENST00000322060 NKX3-2P78367 333 aa22.14■■□□□ 1.13
PUS1-201ENST00000322060 FPGSQ05932 587 aa22.14■■□□□ 1.13
PUS1-201ENST00000322060 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.14■■□□□ 1.13
PUS1-201ENST00000322060 SLFN13Q68D06 897 aa22.14■■□□□ 1.13
PUS1-201ENST00000322060 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms