RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299540.6

AMD1P4-201, Transcript of adenosylmethionine decarboxylase 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene AMD1P4, Length 1,345 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P4-201ENST00000299540 ME3Q16798 604 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 ATG4CQ96DT6 458 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 CPVLQ9H3G5 476 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 RNF186Q9NXI6 227 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 MTMR7Q9Y216 660 aa14.53□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 KLRF2D3W0D1 207 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 PFKFB2O60825 505 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 ALDH1A1P00352 501 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 BCRP11274 1271 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 OSBPP22059 807 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 SLC16A2P36021 539 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 HERVK_113P62684 666 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 PPP2R5BQ15173 497 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 C17orf99Q6UX52 265 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 FAM160B2Q86V87 743 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 MICU3Q86XE3 530 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.52□□□□□ -0.08
AMD1P4-201ENST00000299540 VWA5AO00534 786 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 RAD21O60216 631 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 TLR2O60603 784 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 PEX10O60683 326 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 FLOT1O75955 427 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 STAT2P52630 851 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 SCRN1Q12765 414 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 CRHR2Q13324 411 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 CCDC96Q2M329 555 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 BTBD7Q9P203 1132 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 PNMA3Q9UL41 463 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 ZNF536O15090 1300 aa14.51□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 ATP2A1O14983 1001 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 FGD1P98174 961 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 RTN1Q16799 776 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 Q3C1V9 767 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 SNX21Q969T3 373 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 CTDNEP1O95476 244 aa14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 FDX1P10109 184 aa14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 KIF5BP33176 963 aa14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 GNAQP50148 359 aa14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.49□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 ST18O60284 1047 aa14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 TRPA1O75762 1119 aa14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 TBC1D8O95759 1140 aa14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 IFNAR1P17181 557 aa14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 MB21D1Q8N884 522 aa14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 GTF3C6Q969F1 213 aa14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 KIFC2Q96AC6 838 aa14.48□□□□□ -0.09
AMD1P4-201ENST00000299540 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms