RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 KRT222Q8N1A0 295 aa11.21□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 KIF18AQ8NI77 898 aa11.21□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.21□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.21□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PDCL-201ENST00000259467 NMT2O60551 498 aa11.21□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 NR1I3Q14994 352 aa11.21□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 WDR66Q8TBY9 1149 aa11.21□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PAGE5Q96GU1 130 aa11.21□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 GSDMAQ96QA5 445 aa11.21□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 A0A1B0GTH6 734 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SHTN1A0MZ66 631 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 TMEM232C9JQI7 657 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CYP2D6P10635 497 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SCNN1DP51172 638 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 EPSTI1Q96J88 318 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PBX1P40424 430 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 NOVP48745 357 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 GRM4Q14833 912 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 IL17AQ16552 155 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 TTC38Q5R3I4 469 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 BRMS1Q9HCU9 246 aa11.2□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CCP110O43303 1012 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SERPINC1P01008 464 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 IL1R1P14778 569 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 GPR162Q16538 588 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 ADAMTS3O15072 1205 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CERS3Q8IU89 383 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 TC2NQ8N9U0 490 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 EYA3Q99504 573 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 KIF5BP33176 963 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PTGDRQ13258 359 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 TERF2Q15554 542 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CFAP100Q494V2 611 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 FAM47AQ5JRC9 791 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 COA1Q9GZY4 146 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 USP17L8P0C7I0 530 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SPATA1Q5VX52 437 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 ERO1AQ96HE7 468 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PSMD1Q99460 953 aa11.18□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PSMD14O00487 310 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 ARHGAP6O43182 974 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 NRDCO43847 1150 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 STX10O60499 249 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 FECHP22830 423 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CALML3P27482 149 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 GSTO1P78417 241 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 GALNT17Q6IS24 598 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 MTRQ99707 1265 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PCNTO95613 3336 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 MYH8P13535 1937 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 ETF1P62495 437 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 DHX58Q96C10 678 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 TSPY2A6NKD2 308 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 FANCGO15287 622 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 CXCL9Q07325 125 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 SEMA3FQ13275 785 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 ZNF174Q15697 407 aa11.17□□□□□ -0.62
PDCL-201ENST00000259467 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms