RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258930.7

CIB2-201, Transcript of calcium and integrin binding family member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CIB2, Length 1,598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2-201ENST00000258930 PLA2G6O60733 806 aa29.64■■■□□ 2.34
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CIB2-201ENST00000258930 HOMER1Q86YM7 354 aa29.64■■■□□ 2.34
CIB2-201ENST00000258930 C8orf76Q96K31 380 aa29.64■■■□□ 2.34
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CIB2-201ENST00000258930 PRR12Q9ULL5 1215 aa29.61■■■□□ 2.33
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CIB2-201ENST00000258930 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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CIB2-201ENST00000258930 RGS22Q8NE09 1264 aa29.6■■■□□ 2.33
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CIB2-201ENST00000258930 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CIB2-201ENST00000258930 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa29.59■■■□□ 2.33
CIB2-201ENST00000258930 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CIB2-201ENST00000258930 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa29.59■■■□□ 2.33
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CIB2-201ENST00000258930 USP17L15C9J2P7 530 aa29.58■■■□□ 2.33
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CIB2-201ENST00000258930 USP17L18D6R9N7 530 aa29.58■■■□□ 2.33
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CIB2-201ENST00000258930 hCG_1984214I3L0E3 225 aa29.56■■■□□ 2.32
CIB2-201ENST00000258930 BRD1O95696 1058 aa29.56■■■□□ 2.32
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CIB2-201ENST00000258930 GTF2A2P52657 109 aa29.56■■■□□ 2.32
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CIB2-201ENST00000258930 KRT40Q6A162 431 aa29.56■■■□□ 2.32
CIB2-201ENST00000258930 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.56■■■□□ 2.32
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CIB2-201ENST00000258930 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
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CIB2-201ENST00000258930 SH3GLB2Q9NR46 395 aa29.56■■■□□ 2.32
CIB2-201ENST00000258930 GJB4Q9NTQ9 266 aa29.56■■■□□ 2.32
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CIB2-201ENST00000258930 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
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CIB2-201ENST00000258930 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa29.56■■■□□ 2.32
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CIB2-201ENST00000258930 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CIB2-201ENST00000258930 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.54■■■□□ 2.32
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CIB2-201ENST00000258930 SNAP25P60880 206 aa29.54■■■□□ 2.32
CIB2-201ENST00000258930 CCDC148Q8NFR7 591 aa29.54■■■□□ 2.32
CIB2-201ENST00000258930 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
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CIB2-201ENST00000258930 TRAF1Q13077 416 aa29.53■■■□□ 2.32
CIB2-201ENST00000258930 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.323e-6■■■■□ 21.4
CIB2-201ENST00000258930 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
CIB2-201ENST00000258930 MCTP1Q6DN14 999 aa29.53■■■□□ 2.32
CIB2-201ENST00000258930 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
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