RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.76■■□□□ 1.55
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CITED1-201ENST00000246139 GDF15Q99988 308 aa24.76■■□□□ 1.55
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CITED1-201ENST00000246139 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.72■■□□□ 1.55
CITED1-201ENST00000246139 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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CITED1-201ENST00000246139 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.66■■□□□ 1.54
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CITED1-201ENST00000246139 KCTD1Q719H9 257 aa24.65■■□□□ 1.54
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CITED1-201ENST00000246139 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.64■■□□□ 1.54
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CITED1-201ENST00000246139 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CITED1-201ENST00000246139 CHMLP26374 656 aa24.63■■□□□ 1.53
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CITED1-201ENST00000246139 CCDC96Q2M329 555 aa24.63■■□□□ 1.53
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.63■■□□□ 1.53
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