RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ZMYM6O95789 1325 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TNNC2P02585 160 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CYP2J2P51589 502 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 PHKA1P46020 1223 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 FAM182BQ5T319 152 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC17Q96LX7 622 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 SCG2P13521 617 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 ITIH3Q06033 890 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 MED23Q9ULK4 1368 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CIAO1O76071 339 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 POLA2Q14181 598 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 USP14P54578 494 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 LRMPQ12912 555 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDP1-208ENST00000613122 UBE3CQ15386 1083 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ERFEQ4G0M1 354 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 C8orf74Q6P047 294 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 SPATA24Q86W54 205 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ATP10DQ9P241 1426 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 K7ENM7 598 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEA1P43355 309 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 GMNNO75496 209 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R5DQ14738 602 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 OR52Z1P0C646 297 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ST7Q9NRC1 585 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 SETDB1Q15047 1291 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 FGAP02671 866 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC93Q567U6 631 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 IVLP07476 585 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ME3Q16798 604 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC121Q6ZUS5 278 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 IGBP1P78318 339 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 GIPC1O14908 333 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ZEB2O60315 1214 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 TUBB2AQ13885 445 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 MMS19Q96T76 1030 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 COPRSQ9NQ92 184 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 IQCDQ96DY2 449 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 HS1BP3Q53T59 392 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PTH1RQ03431 593 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 AMNQ9BXJ7 453 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 CEP104O60308 925 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 ADORA1P30542 326 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 PNOCQ13519 176 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDP1-208ENST00000613122 CBX8Q9HC52 389 aa22.29■■□□□ 1.16
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