RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 FAM13AO94988 1023 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 BRD1O95696 1058 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 HMOX1P09601 288 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 CES1P23141 567 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 PDE4CQ08493 712 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 AAMPQ13685 434 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 MSMPQ1L6U9 139 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 C8orf34Q49A92 452 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 CHRDQ9H2X0 955 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 MEGF11A6BM72 1044 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 DLGAP3O95886 979 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 POLD1P28340 1107 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 ARHGAP4P98171 946 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 PXDNLA1KZ92 1463 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 GYS1P13807 737 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 FZD5Q13467 585 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 LCE1DQ5T752 114 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 USP26Q9BXU7 913 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 ADCY9O60503 1353 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-212ENST00000597259 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 RPS6KA4O75676 772 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 TIAF1O95411 115 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 DRD2P14416 443 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 SLC39A6Q13433 755 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 XKR5Q6UX68 686 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 IL17REQ8NFR9 667 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 SCN7AQ01118 1682 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 FOSL1P15407 271 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 KCNA3P22001 575 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PPP2R1AP30153 589 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ARL4DP49703 201 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 DDR1Q08345 913 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 IKBKEQ14164 716 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 NXPE3Q969Y0 559 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 OSMRQ99650 979 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 BCORQ6W2J9 1755 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 MMP10P09238 476 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 ADMP35318 185 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 NFKBIBQ15653 356 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 GPR162Q16538 588 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 OGFOD2Q6N063 350 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 BSNDQ8WZ55 320 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 PCNTO95613 3336 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 SBF1O95248 1867 aa7.19□□□□□ -1.26
HERC3-212ENST00000597259 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms