RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.87■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SNHG28P0DPA3 235 aa22.87■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 APOA5Q6Q788 366 aa22.87■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IFNL1Q8IU54 200 aa22.87■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.86■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BMP3P12645 472 aa22.86■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.86■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DCAF4Q8WV16 495 aa22.86■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PDHXO00330 501 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC96Q2M329 555 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MICU3Q86XE3 530 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.85■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L15C9J2P7 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L11C9JVI0 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L18D6R9N7 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L22D6RA61 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L19D6RCP7 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L20D6RJB6 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDAH1O94760 285 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EVCP57679 992 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF543Q08ER8 600 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L24Q0WX57 530 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.84■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZBTB43O43298 467 aa22.83■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.83■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.83■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RLFQ13129 1914 aa22.83■■□□□ 1.25
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PARP14Q460N5 1801 aa22.83■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM232C9JQI7 657 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CYP2C8P10632 490 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GRM4Q14833 912 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD1Q15327 319 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CPVLQ9H3G5 476 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FLOT1O75955 427 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC16A2P36021 539 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.82■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FANCBQ8NB91 859 aa22.81■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.81■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ST18O60284 1047 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CALM1P0DP23 149 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CALM2P0DP24 149 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CALM3P0DP25 149 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OSBPP22059 807 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 STK3Q13188 491 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAP3K14Q99558 947 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FEM1BQ9UK73 627 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LARGE1O95461 756 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 STAT2P52630 851 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COG2Q14746 738 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIFC2Q96AC6 838 aa22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KLRF2D3W0D1 207 aa22.79■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDC27P30260 824 aa22.79■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PNMA3Q9UL41 463 aa22.79■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DSG3P32926 999 aa22.78■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ME3Q16798 604 aa22.78■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RTN1Q16799 776 aa22.78■■□□□ 1.24
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms