RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		10.66	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF11	Q86T75	865 aa		10.66	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		10.66	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	CPVL	Q9H3G5	476 aa		10.66	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		10.66	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		10.66	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLRF2	D3W0D1	207 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	BACE1	P56817	501 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF543	Q08ER8	600 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC96	Q2M329	555 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	OTUD5	Q96G74	571 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	GMCL1	Q96IK5	515 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	PASK	Q96RG2	1323 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFNAR1	P17181	557 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	FUT2	Q10981	343 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCAF4	Q8WV16	495 aa		10.65	□□□□□ -0.7
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.65	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	IRF6	O14896	467 aa		10.65	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDKL5	O76039	1030 aa		10.65	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	GJB2	P29033	226 aa		10.65	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		10.65	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		10.65	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.65	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		10.65	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	BMP3	P12645	472 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	GNAQ	P50148	359 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMGCS2	P54868	508 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPAT	Q06203	517 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYTH3	O43739	400 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		10.64	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC16A2	P36021	539 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP14	P54578	494 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	LPAR1	Q92633	364 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCNT	O95613	3336 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	HUNK	P57058	714 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	C19orf81	C9J6K1	198 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM232	C9JQI7	657 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	VCAM1	P19320	739 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		10.63	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	GJA5	P36382	358 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPIL2	Q13356	520 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDIT3	P35638	169 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	AIFM3	Q96NN9	605 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAT2	P52630	851 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	C12orf42	Q96LP6	360 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		10.62	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	CXCL11	O14625	94 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMARCA1	P28370	1054 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOMER1	Q86YM7	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	STK36	Q9NRP7	1315 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEXI	O95424	95 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOSB	P53539	338 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	FSTL1	Q12841	308 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	PKP1	Q13835	747 aa		10.61	□□□□□ -0.71
EFTUD2-223	ENST00000592576	PKN1	Q16512	942 aa		10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms