RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF605	Q86T29	641 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	RAG1	P15918	1043 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	DLG4	P78352	724 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	CCDC27	Q2M243	656 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	GMIP	Q9P107	970 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	NUAK1	O60285	661 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	SEMA7A	O75326	666 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	PDE6B	P35913	854 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	CRK	P46108	304 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	GALK1	P51570	392 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	TCTN2	Q96GX1	697 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	EFEMP2	O95967	443 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	LILRA6	Q6PI73	481 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	NLRX1	Q86UT6	975 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	TMEM82	A0PJX8	343 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	ATG4C	Q96DT6	458 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	MAP6	Q96JE9	813 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	GCM1	Q9NP62	436 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	TCFL5	Q9UL49	500 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	NRDC	O43847	1150 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	SGPP1	Q9BX95	441 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	UBP1	Q9NZI7	540 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	GGT7	Q9UJ14	662 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ZNF559-209	ENST00000591652	OR14I1	A6ND48	311 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	PRAMEF1	O95521	474 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	CLC	Q05315	142 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	BBS9	Q3SYG4	887 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	SEZ6	Q53EL9	994 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		6.58	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	SIGLEC6	O43699	453 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	CLEC3A	O75596	197 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	SYP	P08247	313 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	INHBB	P09529	407 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	CCNF	P41002	786 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	SLC14A2	Q15849	920 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	ADGRF1	Q5T601	910 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	ZPBP2	Q6X784	338 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	GK5	Q6ZS86	529 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		6.57	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	FKTN	O75072	461 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		6.56	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	HRK	O00198	91 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	APOBR	Q0VD83	1088 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	TMEM192	Q8IY95	271 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	GIPC2	Q8TF65	315 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	CHST7	Q9NS84	486 aa		6.55	□□□□□ -1.36
ZNF559-209	ENST00000591652	KCTD3	Q9Y597	815 aa		6.55	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms