RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DCAF4Q8WV16 495 aa18.34■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GMCL1Q96IK5 515 aa18.34■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RLFQ13129 1914 aa18.33■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZBTB43O43298 467 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DDAH1O94760 285 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BMP3P12645 472 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KCTD1Q719H9 257 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PCNTO95613 3336 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BTBD19C9JJ37 291 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CALM1P0DP23 149 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CALM2P0DP24 149 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CALM3P0DP25 149 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SNHG28P0DPA3 235 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SREBF2Q12772 1141 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PTPN18Q99952 460 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYH6P13533 1939 aa18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EVCP57679 992 aa18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF543Q08ER8 600 aa18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STK3Q13188 491 aa18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GRM4Q14833 912 aa18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP17L15C9J2P7 530 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP17L11C9JVI0 530 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP17L18D6R9N7 530 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP17L22D6RA61 530 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP17L19D6RCP7 530 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP17L20D6RJB6 530 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PDHXO00330 501 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 USP17L24Q0WX57 530 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IKQ13123 557 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ANKRD23Q86SG2 305 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FANCBQ8NB91 859 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TMEM232C9JQI7 657 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FLOT1O75955 427 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LARGE1O95461 756 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC16A2P36021 539 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 INHBEP58166 350 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RTN1Q16799 776 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IFNL1Q8IU54 200 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IL27Q8NEV9 243 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAP3K14Q99558 947 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CPVLQ9H3G5 476 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIF5BP33176 963 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAP2K2P36507 400 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TM4SF4P48230 202 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STAT2P52630 851 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RCAN1P53805 252 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ME3Q16798 604 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FEM1BQ9UK73 627 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NID2Q14112 1375 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KLRF2D3W0D1 207 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 OSBPP22059 807 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDC27P30260 824 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIFC2Q96AC6 838 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PNMA3Q9UL41 463 aa18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms