RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 DMTNQ08495 405 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 TPH2Q8IWU9 490 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 TBX22Q9Y458 520 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PPFIA4O75335 1185 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 TCP10Q12799 353 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 LGSNQ5TDP6 509 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 RDH13Q8NBN7 331 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 USP44Q9H0E7 712 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CMA1P23946 247 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 RGS12O14924 1447 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 POLD1P28340 1107 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 GPBP1Q86WP2 473 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 BLIDQ8IZY5 108 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC89Q8N998 374 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PLXNC1O60486 1568 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 KRT19P08727 400 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 TECP42680 631 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRTO14522 1441 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 KCNK3O14649 394 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 GNGT1P63211 74 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CPXCR1Q8N123 301 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ZBED4O75132 1171 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CD19P15391 556 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ADCY9O60503 1353 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 BUB1O43683 1085 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CTSWP56202 376 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF827Q17R98 1081 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 TXNDC9O14530 226 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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PTPRM-211ENST00000580170 CASC4Q6P4E1 433 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D31Q96DN5 1066 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8KD6RF30 607 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 HAUS7Q99871 368 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 FANCLQ9NW38 375 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA8P51970 172 aa23.52■■□□□ 1.36
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PTPRM-211ENST00000580170 CLIC6Q96NY7 704 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CLIC4Q9Y696 253 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2J2P51589 502 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 KRIT1O00522 736 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 STAT1P42224 750 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 EPSTI1Q96J88 318 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 ORAI2Q96SN7 254 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 GINS2Q9Y248 185 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 DNM2P50570 870 aa23.51■■□□□ 1.35
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PTPRM-211ENST00000580170 AZI2Q9H6S1 392 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD6Q15008 389 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 NUF2Q9BZD4 464 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L12C9JPN9 530 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L21D6R901 530 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 STX2P32856 288 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 FANCBQ8NB91 859 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 TNNI1P19237 187 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PEX19P40855 299 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 LIG3P49916 1009 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 TCIRG1Q13488 830 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 NSMFQ6X4W1 530 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 STK38LQ9Y2H1 464 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 KCNQ3O43525 872 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 RNF40O75150 1001 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 PANK4Q9NVE7 773 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRM-211ENST00000580170 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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