RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579527.5

TSPOAP1-AS1-203, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,042 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa29.15■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.15■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 INTS13Q9NVM9 706 aa29.15■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.15■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TMEM232C9JQI7 657 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RASA1P20936 1047 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DDR1Q08345 913 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.14■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SLF2Q8IX21 1173 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PAGE5Q96GU1 130 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ZNF827Q17R98 1081 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TEX11Q8IYF3 940 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BLIDQ8IZY5 108 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GSDMAQ96QA5 445 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 POLLQ9UGP5 575 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C16orf86Q6ZW13 317 aa29.12■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PCDHA4Q9UN74 947 aa29.12■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SNED1Q8TER0 1413 aa29.12■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HSPA1LP34931 641 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TMC4Q7Z404 712 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GAKO14976 1311 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 VWA3AA6NCI4 1184 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ERO1AQ96HE7 468 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TMEM47Q9BQJ4 181 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DPYDQ12882 1025 aa29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FLT1P17948 1338 aa29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ADAMTS3O15072 1205 aa29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ARHGAP6O43182 974 aa29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MED15Q96RN5 788 aa29.1■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.09■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 AFMP43652 599 aa29.09■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CDK8P49336 464 aa29.09■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RHBDL3P58872 404 aa29.09■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DAGLBQ8NCG7 672 aa29.09■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 L2HGDHQ9H9P8 463 aa29.09■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SLU7O95391 586 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPATA1Q5VX52 437 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GALNT17Q6IS24 598 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CCDC148Q8NFR7 591 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 STX8Q9UNK0 236 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ZSCAN12O43309 604 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MCM7P33993 719 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TMEM139Q8IV31 216 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IQUBQ8NA54 791 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EYA3Q99504 573 aa29.08■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 M0R2N6 131 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NR1I3Q14994 352 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SP8Q8IXZ3 490 aa29.07■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 A0A1B0GTH6 734 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C6orf229H3BNL8 230 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CUL4BQ13620 913 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SYT10Q6XYQ8 523 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ARID3AQ99856 593 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CYTH3O43739 400 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ETF1P62495 437 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 E2F4Q16254 413 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 WWC2Q6AWC2 1192 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 STX10O60499 249 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TRIM37O94972 964 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 IL17AQ16552 155 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TYW1BQ6NUM6 668 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 C4orf32Q8N8J7 132 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BARHL2Q9NY43 387 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HOMER1Q86YM7 354 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SPZ1Q9BXG8 430 aa29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms