RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575701.4

SRRM2-223, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 3

Gene SRRM2, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-223	ENST00000575701	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	ESR2	Q92731	530 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	PORCN	Q9H237	461 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		29.89	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	ATG4C	Q96DT6	458 aa		29.89	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		29.89	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		29.89	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
SRRM2-223	ENST00000575701	ADCY3	O60266	1144 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	GPR142	Q7Z601	462 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	GJD2	Q9UKL4	321 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	RGS19	P49795	217 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	SOX10	P56693	466 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	SLFN13	Q68D06	897 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	GMCL1	Q96IK5	515 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	NMT2	O60551	498 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	UBXN2A	P68543	259 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	FEM1B	Q9UK73	627 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	PLXNB2	O15031	1838 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	NEDD4	P46934	1319 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	29.85	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	TTC14	Q96N46	770 aa		29.85	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		29.85	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	VWA5A	O00534	786 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	BMP3	P12645	472 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	SKAP1	Q86WV1	359 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	KRT23	Q9C075	422 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	SLC1A4	P43007	532 aa		29.83	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	WDR78	Q5VTH9	848 aa		29.83	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	IQCA1	Q86XH1	822 aa		29.83	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	MROH8	Q9H579	483 aa		29.83	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		29.83	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
SRRM2-223	ENST00000575701	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	SLC25A27	O95847	323 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	COPB2	P35606	906 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	RGS2	P41220	211 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	PTH1R	Q03431	593 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	PLS1	Q14651	629 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	MORN1	Q5T089	497 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		29.81	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	STRN	O43815	780 aa		29.81	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	PTPRE	P23469	700 aa		29.81	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	USP6NL	Q92738	828 aa		29.81	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		29.81	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	KDM4A	O75164	1064 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	FDX1	P10109	184 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	ELN	P15502	786 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	STAT2	P52630	851 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	CASC1	Q6TDU7	716 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	FAM160B2	Q86V87	743 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	DGKH	Q86XP1	1220 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	DCAF4	Q8WV16	495 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	MAP4K1	Q92918	833 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	APBA2	Q99767	749 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701		B4E1Z4	1266 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	PLA2G6	O60733	806 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	HMGCR	P04035	888 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	ERCC3	P19447	782 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	CYP2B6	P20813	491 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	MCC	P23508	829 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	MAP2K5	Q13163	448 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	GRB14	Q14449	540 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	REPS2	Q8NFH8	660 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	TMEM232	C9JQI7	657 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	ZBED4	O75132	1171 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	INHA	P05111	366 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	CYP21A2	P08686	494 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	TRDN	Q13061	729 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	KIFC2	Q96AC6	838 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	ATP2A1	O14983	1001 aa		29.77	■■■□□ 2.36

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