RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557620.2

TPRX1P1-201, Transcript of tetrapeptide repeat homeobox 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TPRX1P1, Length 319 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRX1P1-201ENST00000557620 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.51□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.51□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 TMOD4Q9NZQ9 345 aa7.51□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.51□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 TMEM232C9JQI7 657 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 KLRF2D3W0D1 207 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 ST18O60284 1047 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 DTNBO60941 627 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SNHG28P0DPA3 235 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 PDHBP11177 359 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 BMP3P12645 472 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CDC27P30260 824 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SLC16A2P36021 539 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SLC1A4P43007 532 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 TM4SF4P48230 202 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 INHBEP58166 350 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 ZNF543Q08ER8 600 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CCL15Q16663 113 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 ME3Q16798 604 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 TREML2Q5T2D2 321 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 NBPF11Q86T75 865 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 IL27Q8NEV9 243 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 DCAF4Q8WV16 495 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 LPAR1Q92633 364 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 C12orf42Q96LP6 360 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 MAP3K14Q99558 947 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CPVLQ9H3G5 476 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.5□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 MYH1P12882 1939 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 USP17L15C9J2P7 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 BTBD19C9JJ37 291 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 USP17L11C9JVI0 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 USP17L18D6R9N7 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 USP17L22D6RA61 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 USP17L19D6RCP7 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 USP17L20D6RJB6 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 PDHXO00330 501 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 PFKFB2O60825 505 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 PPFIA3O75145 1194 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 DDAH1O94760 285 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 LARGE1O95461 756 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CALM1P0DP23 149 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CALM2P0DP24 149 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CALM3P0DP25 149 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 VCAM1P19320 739 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 RGS19P49795 217 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SNAP25P60880 206 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 USP17L24Q0WX57 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 COG2Q14746 738 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 GRM4Q14833 912 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CCDC96Q2M329 555 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 MICU3Q86XE3 530 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 HOXC10Q9NYD6 342 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 FEM1BQ9UK73 627 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 SIPA1L1O43166 1804 aa7.49□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 FOCADQ5VW36 1801 aa7.48□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.48□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 PLA2G6O60733 806 aa7.48□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.48□□□□□ -1.21
TPRX1P1-201ENST00000557620 CYP2C8P10632 490 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms