RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 DCAF4Q8WV16 495 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 WDR18Q9BV38 432 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 VCPKMTQ9H867 229 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.15■□□□□ 0.82
LGMN-216ENST00000557434 KIF3CO14782 793 aa20.14■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 NF2P35240 595 aa20.14■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.14■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.14■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 PARP14Q460N5 1801 aa20.14■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 RAD21O60216 631 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 SLC1A4P43007 532 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 SPP2Q13103 211 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 MTMR2Q13614 643 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 CHADLQ6NUI6 762 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 PICK1Q9NRD5 415 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 MTMR6Q9Y217 621 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 STX6O43752 255 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 BRD1O95696 1058 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 SLC16A2P36021 539 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 FOSBP53539 338 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 CST9Q5W186 159 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.13■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 GNAQP50148 359 aa20.12■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 CCDC96Q2M329 555 aa20.12■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.12■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 RLFQ13129 1914 aa20.12■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 USP17L10C9JJH3 530 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 BACE1P56817 501 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 ALG1Q9BT22 464 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 ELP3Q9H9T3 547 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 GOPCQ9HD26 462 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 TRIM75PA6NK02 468 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 DEXIO95424 95 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 BMP3P12645 472 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 SMARCA1P28370 1054 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 FEZ1Q99689 392 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 CSADQ9Y600 493 aa20.11■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 GUCY1B3Q02153 619 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 MTMR8Q96EF0 704 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 SH2D4AQ9H788 454 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.1■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.09■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 GJA5P36382 358 aa20.09■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.09■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.09■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.09■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.09■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 PIGSQ96S52 555 aa20.09■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 TMEM232C9JQI7 657 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 VCAM1P19320 739 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 PDCP20941 246 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 NUCB2P80303 420 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.08■□□□□ 0.81
LGMN-216ENST00000557434 PASKQ96RG2 1323 aa20.08■□□□□ 0.8
LGMN-216ENST00000557434 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
LGMN-216ENST00000557434 IRF6O14896 467 aa20.08■□□□□ 0.8
LGMN-216ENST00000557434 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
LGMN-216ENST00000557434 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
LGMN-216ENST00000557434 HMGCS2P54868 508 aa20.08■□□□□ 0.8
LGMN-216ENST00000557434 C8orf76Q96K31 380 aa20.08■□□□□ 0.8
LGMN-216ENST00000557434 C12orf42Q96LP6 360 aa20.08■□□□□ 0.8
LGMN-216ENST00000557434 TCHHQ07283 1943 aa20.07■□□□□ 0.8
LGMN-216ENST00000557434 ADAMTS3O15072 1205 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms