RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	CTGF	P29279	349 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	COA7	Q96BR5	231 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	SRRD	Q9UH36	339 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	GMCL1	Q96IK5	515 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	MAPK4	P31152	587 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PCNX1-206	ENST00000554292	BMP3	P12645	472 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC1A4	P43007	532 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	DGKH	Q86XP1	1220 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	ATG4C	Q96DT6	458 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	FEM1B	Q9UK73	627 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	CNMD	O75829	334 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	RNF20	Q5VTR2	975 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	NCOA7	Q8NI08	942 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	BTBD7	Q9P203	1132 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292		E7EWF7	191 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	RAET1E	Q8TD07	263 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	DCAF4	Q8WV16	495 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	PEX10	O60683	326 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	MCC	P23508	829 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292		Q3C1V9	767 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	TNKS	O95271	1327 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	PRKCZ	Q05513	592 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM160B2	Q86V87	743 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PCNX1-206	ENST00000554292	VWA5A	O00534	786 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC27A2	O14975	620 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	STAT2	P52630	851 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	NECTIN1	Q15223	517 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	PORCN	Q9H237	461 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	KAT14	Q9H8E8	782 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	MTMR7	Q9Y216	660 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	REC8	O95072	547 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	PLS1	Q14651	629 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC96	Q2M329	555 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKS1A	Q92625	1134 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM232	C9JQI7	657 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	PLA2G6	O60733	806 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	FDX1	P10109	184 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	FLT3LG	P49771	235 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	KIFC2	Q96AC6	838 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	ERICH2	A1L162	156 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	ZBED4	O75132	1171 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	IRF5	Q13568	498 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	WDR78	Q5VTH9	848 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	GPR142	Q7Z601	462 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	NBPF11	Q86T75	865 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	GABRQ	Q9UN88	632 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	PLXNB2	O15031	1838 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	COPB2	P35606	906 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	PNMA1	Q8ND90	353 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC25A27	O95847	323 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	KCTD1	Q719H9	257 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	MROH8	Q9H579	483 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PCNX1-206	ENST00000554292	PDHB	P11177	359 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PCNX1-206	ENST00000554292	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
PCNX1-206	ENST00000554292	ARMC5	Q96C12	935 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PCNX1-206	ENST00000554292	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PCNX1-206	ENST00000554292	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92

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