RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ERO1BQ86YB8 467 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 LAMB1P07942 1786 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 C19orf81C9J6K1 198 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 POTEB2H3BUK9 544 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PRC1O43663 620 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CAPN2P17655 700 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 KIF5BP33176 963 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SHMT1P34896 483 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PPATQ06203 517 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SNAPC2Q13487 334 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 DGKHQ86XP1 1220 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 TBC1D10CQ8IV04 446 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 IL25Q9H293 177 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 MYH8P13535 1937 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 FAM196BA6NMK8 535 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 USP17L10C9JJH3 530 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ADCY3O60266 1144 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 FGRP09769 529 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 RASA1P20936 1047 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 NEK4P51957 841 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 BECN1Q14457 450 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PPP2R5BQ15173 497 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 FAM47AQ5JRC9 791 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZSWIM5Q9P217 1185 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CXCL11O14625 94 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 IRF6O14896 467 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 FOXP2O15409 715 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 INHAP05111 366 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 AKR1B1P15121 316 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ELNP15502 786 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 RPS6KB1P23443 525 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 GNAQP50148 359 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 FCGRTP55899 365 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 TRAF1Q13077 416 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PPIL2Q13356 520 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SLC44A5Q8NCS7 719 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 LPAR1Q92633 364 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 KCNB2Q92953 911 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 NYAP2Q9P242 653 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PNMA3Q9UL41 463 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 TNKSO95271 1327 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 NEDD4P46934 1319 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 LAMA4Q16363 1823 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 TRIM75PA6NK02 468 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 TNFRSF10AO00220 468 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PDHXO00330 501 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CPLX1O14810 134 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CDKL5O76039 1030 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PTPRAP18433 802 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 INPP5BP32019 993 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 LIFRP42702 1097 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 SEPT2Q15019 361 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 HSCBQ8IWL3 235 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CEP95Q96GE4 821 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 WDR18Q9BV38 432 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 PNMA2Q9UL42 364 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 GABRQQ9UN88 632 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-218ENST00000550159 KIF3AQ9Y496 699 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms