RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 BCORQ6W2J9 1755 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 FSD2A1L4K1 749 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GPR25O00155 361 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GNAQP50148 359 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 BACE1P56817 501 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC181Q5TID7 509 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 C12orf60Q5U649 245 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TMTC2Q8N394 836 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 STAP2Q9UGK3 403 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TRAK2O60296 914 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 COG2Q14746 738 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CTR9Q6PD62 1173 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 IFNL1Q8IU54 200 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CEP89Q96ST8 783 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RNF186Q9NXI6 227 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ST18O60284 1047 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CHMLP26374 656 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RHBDL3P58872 404 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 USH1GQ495M9 461 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CHST3Q7LGC8 479 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM47Q96LD4 638 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 STAT2P52630 851 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 LPAR1Q92633 364 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 NEK1Q96PY6 1258 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 UNCXA6NJT0 531 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 BTBD19C9JJ37 291 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PRC1O43663 620 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 STK3Q13188 491 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 KCTD1Q719H9 257 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 TSPY1Q01534 308 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 NOD1Q9Y239 953 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 F5H6K3 240 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-206ENST00000548122 FOXN1O15353 648 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-206ENST00000548122 CALML3P27482 149 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 KLRC3Q07444 240 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 CRHR2Q13324 411 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 FAM160B2Q86V87 743 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRB-206ENST00000548122 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PNMA2Q9UL42 364 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 IGBP1P78318 339 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 ACER1Q8TDN7 264 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 MAP7D2Q96T17 732 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-206ENST00000548122 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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