RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 SPOPO43791 374 aa21.47■■□□□ 1.03
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SUDS3-204ENST00000543473 DYMQ7RTS9 669 aa21.47■■□□□ 1.03
SUDS3-204ENST00000543473 SPATA24Q86W54 205 aa21.47■■□□□ 1.03
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SUDS3-204ENST00000543473 ALKQ9UM73 1620 aa21.47■■□□□ 1.03
SUDS3-204ENST00000543473 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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SUDS3-204ENST00000543473 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.47■■□□□ 1.03
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SUDS3-204ENST00000543473 GBP1P32455 592 aa21.45■■□□□ 1.02
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SUDS3-204ENST00000543473 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.45■■□□□ 1.02
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SUDS3-204ENST00000543473 BRINP3Q76B58 766 aa21.45■■□□□ 1.02
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SUDS3-204ENST00000543473 WDR78Q5VTH9 848 aa21.41■■□□□ 1.02
SUDS3-204ENST00000543473 ASIC3Q9UHC3 531 aa21.41■■□□□ 1.02
SUDS3-204ENST00000543473 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SUDS3-204ENST00000543473 MAGEA9P43362 315 aa21.41■■□□□ 1.02
SUDS3-204ENST00000543473 TRAF1Q13077 416 aa21.41■■□□□ 1.02
SUDS3-204ENST00000543473 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.41■■□□□ 1.02
SUDS3-204ENST00000543473 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.41■■□□□ 1.02
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