RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 CNMDO75829 334 aa21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 RNF20Q5VTR2 975 aa21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 ANKS1AQ92625 1134 aa21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 TRIM47Q96LD4 638 aa21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 TNKSO95271 1327 aa21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 REC8O95072 547 aa21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 BMP3P12645 472 aa21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 HOXD10P28358 340 aa21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 DCAF4Q8WV16 495 aa21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 FEM1BQ9UK73 627 aa21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.63■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PLA2G6O60733 806 aa21.62■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 SLC1A4P43007 532 aa21.62■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 CCNA1P78396 465 aa21.62■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 ATG4CQ96DT6 458 aa21.62■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.62■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 BTBD7Q9P203 1132 aa21.62■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.62■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 MAPK4P31152 587 aa21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 MTA3Q9BTC8 594 aa21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 SRRDQ9UH36 339 aa21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.61■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 HTTP42858 3142 aa21.6■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 SNHG28P0DPA3 235 aa21.6■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 STAT2P52630 851 aa21.6■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 Q3C1V9 767 aa21.6■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.6■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 FAM160B2Q86V87 743 aa21.6■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 VWA5AO00534 786 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 FDX1P10109 184 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PDHBP11177 359 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 MCCP23508 829 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 SEC23AQ15436 765 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 COA7Q96BR5 231 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PLXNB2O15031 1838 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.59■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PEX10O60683 326 aa21.58■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PNMA1Q8ND90 353 aa21.58■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 REPS2Q8NFH8 660 aa21.58■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.58■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 KCNB2Q92953 911 aa21.58■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 PORCNQ9H237 461 aa21.58■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 KAT14Q9H8E8 782 aa21.58■■□□□ 1.05
COPS7A-216ENST00000543170 ERICH2A1L162 156 aa21.57■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM232C9JQI7 657 aa21.57■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 ATP2A1O14983 1001 aa21.57■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 HSPA4P34932 840 aa21.57■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 KRT32Q14532 448 aa21.57■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.57■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 COPB2P35606 906 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 OAZ1P54368 228 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 ANTXR2P58335 489 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 PRKCZQ05513 592 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 IRF5Q13568 498 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC96Q2M329 555 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 GPR142Q7Z601 462 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 ABHD8Q96I13 439 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.56■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 SLC25A27O95847 323 aa21.55■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 MCM5P33992 734 aa21.55■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF543Q08ER8 600 aa21.55■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 KCTD1Q719H9 257 aa21.55■■□□□ 1.04
COPS7A-216ENST00000543170 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms