RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 LRMPQ12912 555 aa10.52□□□□□ -0.73
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PTPRB-204ENST00000538708 XPOTO43592 962 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
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PTPRB-204ENST00000538708 SLC16A2P36021 539 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRB-204ENST00000538708 PSMC4P43686 418 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB33Q86T24 672 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRB-204ENST00000538708 SNX21Q969T3 373 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRB-204ENST00000538708 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRB-204ENST00000538708 SMIM23A6NLE4 172 aa10.49□□□□□ -0.73
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