RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 TNK2Q07912 1038 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 MCTP1Q6DN14 999 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 KIF2CQ99661 725 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ST14Q9Y5Y6 855 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 PTPRGP23470 1445 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF792Q3KQV3 632 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 PI4K2BQ8TCG2 481 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 RNF141Q8WVD5 230 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 C8orf37Q96NL8 207 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ATP10BO94823 1461 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ZP2Q05996 745 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 UBE2FQ969M7 185 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 RGS13O14921 159 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 CBLL1Q75N03 491 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 Q96M66 194 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 NCOA2Q15596 1464 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 MTUS2Q5JR59 1369 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 UACAQ9BZF9 1416 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ASPNQ9BXN1 380 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ABCC2Q92887 1545 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 CCNB3Q8WWL7 1395 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 DTWD2Q8NBA8 298 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM40Q8WWA1 233 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ATG4CQ96DT6 458 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 CNNM2Q9H8M5 875 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 LRRN2O75325 713 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 PAK2Q13177 524 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 UBXN4Q92575 508 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 FGD6Q6ZV73 1430 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 UBOX5O94941 541 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 IMPDH2P12268 514 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 MYOM3Q5VTT5 1437 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 KIF14Q15058 1648 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 RNF4P78317 190 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD62A6NC57 917 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 CCNFP41002 786 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 CERS3Q8IU89 383 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 GPRASP2Q96D09 838 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 PPT2Q9UMR5 302 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ABCC10Q5T3U5 1492 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-214ENST00000530727 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 WASH4PA8MWX3 477 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 BIN1O00499 593 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-214ENST00000530727 CLEC3AO75596 197 aa5.77□□□□□ -1.49
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