RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519081.1

RNU6-988P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 988, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-988P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-988P-201ENST00000519081 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 MAP6Q96JE9 813 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 KIF2CQ99661 725 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 PARP2Q9UGN5 583 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 F6X3S4 739 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 RFXAPO00287 272 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 N4BP3O15049 544 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 USP2O75604 605 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 UBOX5O94941 541 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 SYN1P17600 705 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 VIPR1P32241 457 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 TNNI2P48788 182 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 NFKB2Q00653 900 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 NFIXQ14938 502 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 ADGRF1Q5T601 910 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 HHIPL1Q96JK4 782 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 RGS13O14921 159 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 GARTP22102 1010 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 BBS9Q3SYG4 887 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 LINC00116Q8NCU8 138 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 TCTN2Q96GX1 697 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLCD4Q9BRC7 762 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 KLHL3Q9UH77 587 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 IRAK3Q9Y616 596 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 ADAMTS20P59510 1910 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 GRIN3BO60391 1043 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 BPNT1O95861 308 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 PNLIPP16233 465 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 RPL10P27635 214 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 CDR1P51861 262 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 ERVFRD-1P60508 538 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZPBP2Q6X784 338 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 WAPLQ7Z5K2 1190 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM74Q96NL1 305 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 RSRP1Q9BUV0 290 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-988P-201ENST00000519081 ANKRD33BA6NCL7 494 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 SDHBP21912 280 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 MPP2Q14168 576 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 KIR3DS1Q14943 382 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 CEP128Q6ZU80 1094 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMC4Q7Z404 712 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 REC114Q7Z4M0 266 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 FBXO27Q8NI29 283 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 TCFL5Q9UL49 500 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 GBP1P32455 592 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM129CQ86XR2 697 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 FEZF2Q8TBJ5 459 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 MZB1Q8WU39 189 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 FADS2P1A8MWK0 482 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 SASH1O94885 1247 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 PSMD2Q13200 908 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC14A2Q15849 920 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 VMACQ2NL98 169 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 GGNQ86UU5 652 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM161BQ96MY7 647 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 ATE1O95260 518 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 PRAMEF1O95521 474 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 RTP1P59025 263 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 RNF4P78317 190 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 ARSHQ5FYA8 562 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 CDCP2Q5VXM1 449 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 LDHDQ86WU2 507 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 RELL1Q8IUW5 271 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-988P-201ENST00000519081 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms