RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIAA2012Q0VF49 1180 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 LAPTM5Q13571 262 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRM2Q14416 872 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 INPP5AQ14642 412 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDSNQ15517 529 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM164Q5U3C3 297 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CEP128Q6ZU80 1094 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 HDXQ7Z353 690 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCUBE1Q8IWY4 988 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CARFQ8N187 725 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRDM14Q9GZV8 571 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 KLC2Q9H0B6 622 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC87Q9NVE4 849 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CEP131Q9UPN4 1083 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 AKAP2Q9Y2D5 859 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF536O15090 1300 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCSK5Q92824 1860 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUDT19A8MXV4 375 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 USP2O75604 605 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 SARSP49591 514 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 RTP1P59025 263 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 HTRA3P83110 453 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYP4F8P98187 520 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 DPTQ07507 201 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 NR1I3Q14994 352 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 LLGL2Q6P1M3 1020 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 GALNT18Q6P9A2 607 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 TTLL7Q6ZT98 887 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 BHLHA9Q7RTU4 235 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 LIMS2Q7Z4I7 341 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 WAPLQ7Z5K2 1190 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 DTWD2Q8NBA8 298 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC74AQ96AQ1 378 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 VOPP1Q96AW1 172 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CRAMP1Q96RY5 1269 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF341Q9BYN7 854 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 DEF6Q9H4E7 631 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGSF5Q9NSI5 407 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYP8B1Q9UNU6 501 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAN1Q9Y2M0 1017 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATG7O95352 703 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAPKAPK2P49137 400 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 MTMR3Q13615 1198 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC6A19Q695T7 634 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRFN4Q6PJG9 635 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPTNQ6XPR3 784 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 RNF111Q6ZNA4 994 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PALM2Q8IXS6 379 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 LGI4Q8N135 537 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 USHBP1Q8N6Y0 703 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZG16BQ96DA0 208 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLPPR2Q96GM1 343 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAP6Q96JE9 813 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLCD4Q9BRC7 762 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 IKZF4Q9H2S9 585 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 SEMA4AQ9H3S1 761 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 INVSQ9Y283 1065 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A087X1B8 175 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPIPB8E9PQR5 432 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRN2O75325 713 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 NCAM1P13591 858 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATF2P15336 505 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRKCAP17252 672 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRK4P32298 578 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ABHD18Q0P651 414 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 PDE3BQ13370 1112 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ORC1Q13415 861 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ICAM4Q14773 271 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIR3DS1Q14943 382 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 SURF1Q15526 300 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF585AQ6P3V2 769 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 BORAQ6PGQ7 559 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM124AQ86V42 546 aa1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms