RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CHPFQ8IZ52 775 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 COG1Q8WTW3 980 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 HOOK2Q96ED9 719 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SLC39A13Q96H72 371 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CDH19Q9H159 772 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GFRA3O60609 400 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CAND2O75155 1236 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ASLP04424 464 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 JMJD7P0C870 316 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CD247P20963 164 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 IGFALSP35858 605 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 MAP2K3P46734 347 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ID4P47928 161 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GABREP78334 506 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 RNF214Q8ND24 703 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TTC8Q8TAM2 541 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 DISC1Q9NRI5 854 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 RAD18Q9NS91 495 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 WHRNQ9P202 907 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 AKT3Q9Y243 479 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 M0R082 166 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 NEMP1O14524 444 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GABRDO14764 452 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 BRINP1O60477 761 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 LILRB5O75023 590 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 EFCAB14O75071 495 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PPM1BO75688 479 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 RGS20O76081 388 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 APBA3O96018 575 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CNTD1Q8N815 330 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 BRF1Q92994 677 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CHST12Q9NRB3 414 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 MBIPQ9NS73 344 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PLIN1O60240 522 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 KCNH1O95259 989 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 BPIP17213 487 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CAP2P40123 477 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GFRA1P56159 465 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TTLL4Q14679 1199 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PTPRN2Q92932 1015 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 TTC1Q99614 292 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GP6Q9HCN6 339 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ASXL2Q76L83 1435 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 DLL1O00548 723 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 EPXP11678 715 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ITGA4P13612 1032 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CFAP100Q494V2 611 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ILDR2Q71H61 639 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-209ENST00000504994 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.54□□□□□ -1.36
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