RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	HTR3B	O95264	441 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	GART	P22102	1010 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	PDE6B	P35913	854 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	NFKB2	Q00653	900 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	MAP6	Q96JE9	813 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	RGS13	O14921	159 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	N4BP3	O15049	544 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	PF4	P02776	101 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	SYN1	P17600	705 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	PI3	P19957	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	NFIX	Q14938	502 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	RFXAP	O00287	272 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	UBOX5	O94941	541 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	PNLIP	P16233	465 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	VIPR1	P32241	457 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	EPHB3	P54753	998 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	ERVFRD-1	P60508	538 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	BBS9	Q3SYG4	887 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	TMC4	Q7Z404	712 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	TCTN2	Q96GX1	697 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	PARP2	Q9UGN5	583 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM74	Q96NL1	305 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	KIF2C	Q99661	725 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	IRAK3	Q9Y616	596 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	BPNT1	O95861	308 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CDR1	P51861	262 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	MPP2	Q14168	576 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ADGRF1	Q5T601	910 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	REC114	Q7Z4M0	266 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	LRRC3	Q9BY71	257 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ATE1	O95260	518 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	TNNI2	P48788	182 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CAP1	Q01518	475 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	FAM129C	Q86XR2	697 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	KLHL3	Q9UH77	587 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	TCFL5	Q9UL49	500 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	GRIN3B	O60391	1043 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	RNF4	P78317	190 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ZPBP2	Q6X784	338 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	FBXO27	Q8NI29	283 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	MZB1	Q8WU39	189 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952		F6X3S4	739 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	ABLIM1	O14639	778 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CRELD1	Q96HD1	420 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	GREM1	O60565	184 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SASH1	O94885	1247 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	SDHB	P21912	280 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	EFEMP1	Q12805	493 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	PSMD2	Q13200	908 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	KIR3DS1	Q14943	382 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
TTC3-222	ENST00000491952	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5

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