RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 HDAC8Q9BY41 377 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 GGT7Q9UJ14 662 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.16□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 PDE6BP35913 854 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF605Q86T29 641 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 GIPC2Q8TF65 315 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 EBF1Q9UH73 591 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
NELFCD-210ENST00000490205 PEX10O60683 326 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 CCNFP41002 786 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 CRKP46108 304 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SEZ6Q53EL9 994 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 ATG4CQ96DT6 458 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 TCTN2Q96GX1 697 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.14□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 PSPNO60542 156 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SEMA7AO75326 666 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 CLEC3AO75596 197 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 MCM4P33991 863 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF165P49910 485 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 APOBRQ0VD83 1088 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 LCE4AQ5TA78 99 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 GK5Q6ZS86 529 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 UBP1Q9NZI7 540 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 TCFL5Q9UL49 500 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 NUAK1O60285 661 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 LINC00310P59036 64 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 CLCQ05315 142 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SLC14A2Q15849 920 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 NKD1Q969G9 470 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SHISA4Q96DD7 197 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 MAP6Q96JE9 813 aa6.12□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SIGLEC6O43699 453 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 NRDCO43847 1150 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 PRAMEF1O95521 474 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 DLG4P78352 724 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 NLRX1Q86UT6 975 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM82A0PJX8 343 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 OR14I1A6ND48 311 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 NOTOA8MTQ0 251 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SYPP08247 313 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 GALK1P51570 392 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 ADGRF1Q5T601 910 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 TNFRSF10CO14798 259 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 FKTNO75072 461 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 BBS9Q3SYG4 887 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.09□□□□□ -1.43
NELFCD-210ENST00000490205 SLC6A18Q96N87 628 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms