RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-209ENST00000486016 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 GMIPQ9P107 970 aa7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.28□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.28□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 GBP1P32455 592 aa7.28□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 SNX17Q15036 470 aa7.28□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.28□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 RELTQ969Z4 430 aa7.28□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.28□□□□□ -1.24
GCFC2-209ENST00000486016 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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GCFC2-209ENST00000486016 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.27□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.27□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.27□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 MCOLN1Q9GZU1 580 aa7.27□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 TMEM82A0PJX8 343 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 NUAK1O60285 661 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 PSPNO60542 156 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 KCNN1Q92952 543 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 ATG4CQ96DT6 458 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 UBP1Q9NZI7 540 aa7.26□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 PEX10O60683 326 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 RAG1P15918 1043 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 RNF4P78317 190 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 CLCQ05315 142 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 DUSP4Q13115 394 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 MLECQ14165 292 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 NLRX1Q86UT6 975 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 TCTN2Q96GX1 697 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 GGT7Q9UJ14 662 aa7.25□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 BBS9Q3SYG4 887 aa7.24□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.24□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.24□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 GCM1Q9NP62 436 aa7.24□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 CCNFP41002 786 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 LINC00310P59036 64 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 DLG4P78352 724 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 SEZ6Q53EL9 994 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 GIPC2Q8TF65 315 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.23□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 SIGLEC6O43699 453 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 GALK1P51570 392 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 TMEM192Q8IY95 271 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 MAP6Q96JE9 813 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 GPR160Q9UJ42 338 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 TCFL5Q9UL49 500 aa7.22□□□□□ -1.25
GCFC2-209ENST00000486016 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 TNFRSF10CO14798 259 aa7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 NRDCO43847 1150 aa7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 SEMA7AO75326 666 aa7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 PRAMEF1O95521 474 aa7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 ZPBP2Q6X784 338 aa7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF605Q86T29 641 aa7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.21□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GCFC2-209ENST00000486016 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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